ASAUM’un amaçları arasında, Türkiye’nin iç sularında (göl, gölet, akarsular) ve denizlerinde ülkenin gereksinim duyduğu kirlenme, limnoloji ve oşinografi araştırmalarının yapılması, su kaynaklarının kullanılması, yönetimi ve bitkisel veya hayvansal orijinli ürünlerin üretimi, toplanması, avlanması, işlenmesi, yetiştiricilik tesislerine yönelik etütlerin yapılması, planlanması veya projelendirilmesi, balık hastalıklarının teşhis ve tedavisine yönelik çalışmaların yapılması konularında ulusal ve uluslararası çapta çalışmaların yapılması yer almaktadır.
ASAUM, Ankara Üniversitesi Ziraat Fakültesi Su Ürünleri Bölümü bünyesinde faaliyetlerini sürdürmektedir. ASAUM, amaçları doğrultusunda periyodik olarak seminer, çalıştay ve kurslar düzenlemektedir.